Los procesos a Hidalgo y varios clérigos –incluyendo a Morelos– exponen disyuntivas doctrinales de la época, de acuerdo con historiadores. Mientras los curas rebeldes se justificaron en la teología de la Guerra Justa, cuyo concepto fundamentó las cruzadas, la Conquista y, por supuesto, a los curas guerrilleros de la Independencia, los católicos conservadores reivindican a Iturbide como el verdadero consumador y protagonista del movimiento de emancipación. Las posiciones antagónicas atravesaron la Iglesia católica.